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while (<>) { next if /##/; chomp; @a=split/\s+/; @b=split/:/,$a[9];#获取0/1,1/1,1/3这样的格式的基因型 @allel=split/,/,$a[4]; $hash{0}=$a[3]; $i=1; foreach (@allel) { $hash{$i}=$_; $i++; }#把基因型对应到0,1,2,3,4的hash表里面 #print "$hash{$_}\t" foreach keys %hash; #print "\n"; @b=split/:/,$a[9]; $GT=$b[0]; $b[0]=~s:(\d).*(\d):$hash{$1}/$hash{$2}:; #根据hash表里面的内容选择性输出基因型对应的碱基 print "$a[0]\t$a[1]\t$a[3]\t$a[4]\t$GT\t$b[0]\n"; undef %hash; }